武昌起义胜利，章太炎提出了“革命军起，革命党消”④的错误口号，主张解散同盟会，并和一些立宪党人在一起，组织中华民国联合会。1912年1月1日，孙中山在南京就任临时大总统，聘任章太炎为总统府枢密顾问，他不愿常驻南京，返回上海。2月中旬，在讨论建都问题时，章太炎主张建都北京，认为“中国本因旧之国，非新辟之国，其良法美俗，应保存者则存留之，不能事事更张也”⑤。他依恋旧制度，说“专制非无良规，共和非无粃政”，“政治法律，皆依习惯而成”①，主张中央“特建都察院”，“限制元首”，地方“废省存道”，而对代议民主制则表示反对，主张“限制财产”，又以“夺富者之田以与贫民”为“大悖乎理”②。
       南北和议告成，袁世凯上台，章太炎幻想袁世凯“厉精法治”，“以厝中夏于泰山磐石之安”③。在用人问题上，以为“同盟会人材乏绝，清流不归”④。反对“政党内阁”，提出“取清时南方督抚有材名者以充阁员之选”⑤。说什么：“汉之良相，即亡秦之退官；唐之名臣，即败隋 ......

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