孔靖字季恭，会稽郡山阴人。名字和高祖的祖父名字相同，所以用字自称。他的祖父孔愉是晋朝的车骑将军，父亲孔躢官至散骑常侍。
       孔靖最初被选为本郡的孝廉、功曹史、著作佐郎、太子舍人、镇军司马、司徒左西掾。还未赴任，便遇上母亲去世。隆安五年(401)。孔靖在守孝期间便被起用为建威将军、山阴令。他婉言拒绝上任。高祖东征孙恩，几次到会稽，孔靖热情接待，给高祖很多礼物。高祖后来讨伐孙恩，当时桓玄篡夺帝位的意图渐渐显露，高祖想在山阴起义讨伐，孔靖认为山阴离都城太远，而且桓玄还未称帝，不如等待他篡夺形势明显，罪恶昭彰的时候慢慢在京口图谋他，那样不怕不成功。高祖也认为这计策很好。虞啸父当东征将军、会稽内史，孔靖起初求请当他的府中司马，但未实现。到高祖平定桓玄，用孔靖当会稽内史，叫人拿着封板任命孔靖，在路上和孔靖相遇，孔靖便转过船来回到郡上。回来后便敲虞啸父的门告诉他此事，并叫虞啸父扫其他的房子，孔靖便上任了。虞啸父本来是桓玄任命的，听说桓玄 ......

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